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Rédigé par le Dr Guillaume Teissier, médecin biologiste

L’ECBU est le seul examen complémentaire recommandé pour le diagnostic d’infection urinaire masculine. La bandelette urinaire n’a pas d’indication chez l’homme.
Nouveauté : apparition de l’entité clinique « cystite aiguë » chez l’homme.

Les recommandations SPILF 2026 distinguent trois tableaux cliniques et placent l'ECBU au centre du diagnostic biologique.

Cystite aiguë bactérienne

La cystite aiguë bactérienne existe chez l’homme.

Diagnostic

  1. Signes fonctionnels urinaires (brûlures urétrales per-mictionnelles, pollakiurie, urgenturie…)
  2. D’apparition aiguë,
  3. Et absence de fièvre (température < 38 °C) ou de frissons,
  4. Et ECBU positif

Antibiothérapie probabiliste

Si bonne tolérance ou doute diagnostic : attendre les résultats de l’ECBU.
Sinon : Fosfomycine-trométamol OU Nitrofurantoïne OU Pivmécillinam

Après documentation

Poursuite du traitement probabiliste si uropathogène sensible et bonne tolérance.
Dans le cas contraire, l’antibiothérapie doit être adaptée comme suit (par ordre alphabétique) :

  1. Amoxicilline
  2. Fosfomycine-trométamol
  3. Nitrofurantoïne
  4. Pivmécillinam
  5. Triméthoprime

Durée totale d’antibiothérapie active sur le pathogène

Cystite masculine : 7 jours (sauf fosfomycine-trométamol : 3 doses)

Prostatite aiguë (température ≥ 38°C)

Diagnostic

  1. Signes cliniques de cystite,
  2. Avec fièvre ou manifestations systémiques d’infection (frissons…)
  3. Et ECBU positif

Antibiothérapie probabiliste

  1. Patient ambulatoire : Ceftriaxone OU Ciprofloxacine OU Lévofloxacine (FQ si pas de FQ dans les 6 mois).
  2. Patient hospitalisé : recommandations.

Après documentation

Relais oral possible, par ordre préférentiel : Sulfaméthoxazole-triméthoprime OU Ciprofloxacine OU Lévofloxacine PO.

  1. Si résistance ou contre-indication à l’association sulfaméthoxazole-triméthoprime et aux fluoroquinolones, après retour à l’apyrexie et par ordre préférentiel : Fosfomycine-trométamol OU Amoxicilline OU Amoxicilline-acide clavulanique.
  2. Si Enterococcus sp : Amoxicilline.

Si pas de relais oral possible : Céfotaxime OU Ceftriaxone.

  1. Si résistance aux C3G : cf. recommandations.

Durée totale d’antibiothérapie active sur le pathogène

Prostatite aiguë : 14 jours

Pyélonéphrite aiguë (température ≥ 38 °C)

Diagnostic

  1. Douleurs lombaires spontanées ou à l’ébranlement,
  2. Avec fièvre ou manifestations systémiques d’infection (frissons…)
  3. +/- signes de cystite
  4. Et ECBU positif

Antibiothérapie probabiliste

Patient ambulatoire : Ceftriaxone OU Ciprofloxacine OU Lévofloxacine (FQ si pas de FQ dans les 6 mois).
Patient hospitalisé : recommandations.

Après documentation

Relais oral possible, par ordre préférentiel :

  1. Amoxicilline
  2. Sulfaméthoxazole-triméthoprime
  3. Amoxicilline-acide clavulanique
  4. Ciprofloxacine OU Lévofloxacine
  5. Céfixime

Si pas de relais oral possible : Céfotaxime OU Ceftriaxone.

  1. Si résistance aux C3G : cf. recommandations.

Durée totale d’antibiothérapie active sur le pathogène

Pyélonéphrite aiguë : 7 jours si traitement par bêta-lactamine parentérale, fluoroquinolones et/ou sulfaméthoxazole-triméthoprime.
10 jours si autres antibiotiques.

Posologies recommandées

  1. Amikacine : 30 mg/kg/j en 30 min
  2. Amoxicilline +/- acide clavulanique : 1 g/8 h
  3. Céfépime : 1 à 2 g/8 h
  4. Céfixime : 200 mg/12 h
  5. Céfotaxime : 1 à 2 g/8 h
  6. Céfoxitine : 6 g/24 h
  7. Ceftriaxone : 1 à 2 g/24 h
  8. Ciprofloxacine : 500 mg/12 h
  9. Ertapénème : 1 g/j
  10. Fosfomycine-trométamol : cystite : 3 g à J1-J3-J5 / prostatite : 3 g/j
  11. Imipénème : 500 mg à 1 g/8 h
  12. Lévofloxacine : 500 mg/24 h
  13. Méropénème : 1 à 2 g/8 h
  14. Nitrofurantoïne : 100 mg/8 h
  15. Ofloxacine : 200 mg/12 h
  16. Pipéracilline-tazobactam : 4 g/8 h
  17. Pivmécillinam : 400 mg/12 h
  18. Témocilline : 2 g/8 h
  19. Triméthoprime : 300 mg/24 h
  20. Triméthoprime-sulfaméthoxazole 160/800 : 1 cp/12 h
Les durées d'antibiothérapie diffèrent selon le type d'infection et le traitement utilisé

Épidémiologie Inovie Labosud 2026 sur les infections urinaires masculines

Écologie bactérienne

5 bactéries représentent près de 80 % des bactéries responsables d’infections urinaires : E. coli (53 %), K. pneumoniae (10 %), E. faecalis, P. mirabilis, C. koseri.

Données de résistance aux antibiotiques (en %)

AntibiotiqueE. coliK. pneumoniaeP. mirabilisC. koseri
Amoxicilline (Clamoxyl®)64,7100,036100
Pivmécillinam (Selexid®)16,28,612,52
Ceftriaxone (Rocéphine®)10,515,00,20,5
Lévofloxacine (Tavanic®)19,615,75,31,2
Ciprofloxacine (Ciflox®)19,615,75,31,2
Cotrimoxazole (Bactrim®)28,918,733,81,8
Fosfomycine-trométamol (Monuril®)1,861,012,61,5
Nitrofurantoïne (Furadantine®)0,570,010010,2

Source : données épidémiologiques Inovie Labosud 2026.

Rappel sur le rendu des antibiogrammes

Depuis plusieurs années, les antibiogrammes des germes isolés dans les urines sont ciblés selon les recommandations de la HAS, de la SPILF et de la SFM pour aider au choix du bon antibiotique et ainsi lutter contre l’antibiorésistance :

  1. L’antibiogramme ciblé concerne le rendu des molécules.
  2. La liste des molécules testées par le laboratoire reste inchangée : possibilité d’obtenir l’antibiogramme complet sur demande du médecin au laboratoire.
  3. Plusieurs études cliniques ont prouvé l’intérêt de l’antibiogramme ciblé, avec des baisses de prescription de C3G, d’Augmentin et de fluoroquinolones.

Pour certaines bactéries isolées d’un prélèvement urinaire, comme E. faecalis ou S. saprophyticus, le rendu d’un commentaire précisant le profil de sensibilité aux antibiotiques de la bactérie isolée remplace l’antibiogramme. Ce profil est basé sur nos données de résistances pour certaines bactéries présentant rarement des résistances acquises. Cette modalité permet un rendu plus rapide de l’ECBU (1 ou 2 jours avant), une aide à la prescription et donc un gain de temps pour une éventuelle réévaluation thérapeutique.

Nos données de résistance bactérienne aux antibiotiques sont aussi consolidées dans le réseau « Medqual ville », auquel nous contribuons depuis plusieurs années.

Sources

  • Updated guidelines for management of community-acquired urinary tract infections in adult men by the French infectious disease society (SPILF) – Infectious Diseases Now – juin 2026
  • Recommandations SPILF juin 2026 – IUMACA
  • Données épidémiologiques Inovie Labosud 2026
  • Comité de l’antibiogramme de la Société Française de Microbiologie – Recommandations 2023 V.1.0 juin
  • HAS – Antibiogrammes ciblés pour les infections urinaires à entérobactéries dans la population féminine adulte (à partir de 12 ans) – octobre 2023
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